MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 53279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010831	CAG	2	6	29	34	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499001
2	NC_010831	T	6	6	164	169	0 %	100 %	0 %	0 %	189499001
3	NC_010831	T	7	7	205	211	0 %	100 %	0 %	0 %	189499001
4	NC_010831	GAA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499001
5	NC_010831	GAAA	2	8	258	265	75 %	0 %	25 %	0 %	189499001
6	NC_010831	AGCC	2	8	319	326	25 %	0 %	25 %	50 %	189499001
7	NC_010831	TCA	2	6	345	350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499001
8	NC_010831	GGC	2	6	577	582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499001
9	NC_010831	ATG	2	6	604	609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499001
10	NC_010831	CGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499001
11	NC_010831	T	6	6	778	783	0 %	100 %	0 %	0 %	189499001
12	NC_010831	A	6	6	794	799	100 %	0 %	0 %	0 %	189499001
13	NC_010831	GAA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499001
14	NC_010831	ATCA	2	8	836	843	50 %	25 %	0 %	25 %	189499001
15	NC_010831	ATC	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499001
16	NC_010831	GAG	2	6	898	903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499001
17	NC_010831	ATT	2	6	976	981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499001
18	NC_010831	AAGC	2	8	984	991	50 %	0 %	25 %	25 %	189499001
19	NC_010831	TGA	2	6	1014	1019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499001
20	NC_010831	CCA	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189499001
21	NC_010831	CTT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499001
22	NC_010831	CT	3	6	1104	1109	0 %	50 %	0 %	50 %	189499001
23	NC_010831	ATC	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499001
24	NC_010831	A	7	7	1176	1182	100 %	0 %	0 %	0 %	189499001
25	NC_010831	A	6	6	1261	1266	100 %	0 %	0 %	0 %	189499001
26	NC_010831	CGC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189499001
27	NC_010831	GGA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499001
28	NC_010831	CACAA	2	10	1384	1393	60 %	0 %	0 %	40 %	189499001
29	NC_010831	CGG	2	6	1415	1420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499001
30	NC_010831	AGA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499001
31	NC_010831	A	6	6	1447	1452	100 %	0 %	0 %	0 %	189499001
32	NC_010831	CAA	2	6	1517	1522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010831	CG	3	6	1576	1581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010831	AC	3	6	1618	1623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010831	TGT	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010831	CAC	2	6	1644	1649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010831	ACA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010831	A	7	7	1690	1696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010831	CA	3	6	1716	1721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010831	CAA	5	15	1724	1738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010831	ATA	2	6	1754	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010831	AAG	2	6	1760	1765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010831	CAA	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499002
44	NC_010831	ACGG	2	8	1911	1918	25 %	0 %	50 %	25 %	189499002
45	NC_010831	CAA	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499002
46	NC_010831	TTC	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499002
47	NC_010831	GAG	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499002
48	NC_010831	CAG	2	6	2049	2054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499002
49	NC_010831	AAC	2	6	2204	2209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499002
50	NC_010831	GTA	2	6	2218	2223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499002
51	NC_010831	ATG	2	6	2244	2249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499002
52	NC_010831	ACGG	2	8	2295	2302	25 %	0 %	50 %	25 %	189499002
53	NC_010831	CCAG	2	8	2370	2377	25 %	0 %	25 %	50 %	189499002
54	NC_010831	TC	3	6	2381	2386	0 %	50 %	0 %	50 %	189499002
55	NC_010831	AG	3	6	2465	2470	50 %	0 %	50 %	0 %	189499002
56	NC_010831	TGC	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499002
57	NC_010831	CTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499002
58	NC_010831	CGG	2	6	2656	2661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499002
59	NC_010831	AGG	2	6	2689	2694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499002
60	NC_010831	TCG	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499002
61	NC_010831	CAA	2	6	2809	2814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499002
62	NC_010831	GAGAAA	2	12	2835	2846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499002
63	NC_010831	GAAAAT	2	12	2847	2858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189499002
64	NC_010831	ATG	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499002
65	NC_010831	TGT	2	6	2991	2996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499003
66	NC_010831	ACT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499003
67	NC_010831	TGA	2	6	3138	3143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499003
68	NC_010831	A	7	7	3179	3185	100 %	0 %	0 %	0 %	189499003
69	NC_010831	A	7	7	3193	3199	100 %	0 %	0 %	0 %	189499003
70	NC_010831	TGA	2	6	3213	3218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499003
71	NC_010831	A	6	6	3223	3228	100 %	0 %	0 %	0 %	189499003
72	NC_010831	CTTT	2	8	3280	3287	0 %	75 %	0 %	25 %	189499003
73	NC_010831	GAT	2	6	3361	3366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499003
74	NC_010831	CTG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499003
75	NC_010831	AGA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499003
76	NC_010831	GCT	2	6	3405	3410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499003
77	NC_010831	TTGT	2	8	3523	3530	0 %	75 %	25 %	0 %	189499003
78	NC_010831	GAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499003
79	NC_010831	T	6	6	3635	3640	0 %	100 %	0 %	0 %	189499003
80	NC_010831	ATG	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499003
81	NC_010831	A	6	6	3754	3759	100 %	0 %	0 %	0 %	189499003
82	NC_010831	TACA	2	8	3812	3819	50 %	25 %	0 %	25 %	189499003
83	NC_010831	TAC	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499003
84	NC_010831	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499003
85	NC_010831	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	189499003
86	NC_010831	AGA	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499003
87	NC_010831	ACAA	2	8	4050	4057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010831	TTC	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010831	TGA	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010831	ATC	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499004
91	NC_010831	GAT	2	6	4151	4156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499004
92	NC_010831	GAAG	2	8	4186	4193	50 %	0 %	50 %	0 %	189499004
93	NC_010831	GGA	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499004
94	NC_010831	CT	3	6	4319	4324	0 %	50 %	0 %	50 %	189499004
95	NC_010831	A	8	8	4331	4338	100 %	0 %	0 %	0 %	189499004
96	NC_010831	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499004
97	NC_010831	CAG	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499004
98	NC_010831	TAA	2	6	4354	4359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499004
99	NC_010831	AGG	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010831	TAT	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010831	GT	3	6	4456	4461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010831	AAT	2	6	4473	4478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010831	GTA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010831	TAA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010831	AAT	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010831	TTTG	2	8	4569	4576	0 %	75 %	25 %	0 %	189499005
107	NC_010831	TTGTGC	2	12	4591	4602	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	189499005
108	NC_010831	TGC	2	6	4622	4627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499005
109	NC_010831	TCCT	2	8	4732	4739	0 %	50 %	0 %	50 %	189499005
110	NC_010831	GAT	2	6	4770	4775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499005
111	NC_010831	GAA	2	6	4776	4781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499005
112	NC_010831	CG	3	6	4815	4820	0 %	0 %	50 %	50 %	189499005
113	NC_010831	GGT	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189499005
114	NC_010831	T	6	6	4862	4867	0 %	100 %	0 %	0 %	189499005
115	NC_010831	TGTT	2	8	4870	4877	0 %	75 %	25 %	0 %	189499005
116	NC_010831	GCA	2	6	4917	4922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499005
117	NC_010831	TCT	2	6	4970	4975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499005
118	NC_010831	GGTA	2	8	5024	5031	25 %	25 %	50 %	0 %	189499005
119	NC_010831	TCT	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499005
120	NC_010831	T	6	6	5082	5087	0 %	100 %	0 %	0 %	189499005
121	NC_010831	TCA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499005
122	NC_010831	TCA	2	6	5218	5223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499005
123	NC_010831	GTT	2	6	5258	5263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499005
124	NC_010831	A	6	6	5368	5373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010831	TTG	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010831	AAT	2	6	5778	5783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499006
127	NC_010831	GCA	2	6	5860	5865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499006
128	NC_010831	CAA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499006
129	NC_010831	TTC	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499006
130	NC_010831	CA	3	6	5983	5988	50 %	0 %	0 %	50 %	189499006
131	NC_010831	T	6	6	6029	6034	0 %	100 %	0 %	0 %	189499006
132	NC_010831	T	7	7	6123	6129	0 %	100 %	0 %	0 %	189499006
133	NC_010831	GCA	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499006
134	NC_010831	ATA	2	6	6267	6272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189499006
135	NC_010831	TCG	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499006
136	NC_010831	ATC	2	6	6303	6308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499006
137	NC_010831	AGT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189499006
138	NC_010831	TCT	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499006
139	NC_010831	AGA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499006
140	NC_010831	CAA	2	6	6605	6610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499006
141	NC_010831	TTATC	2	10	6647	6656	20 %	60 %	0 %	20 %	189499006
142	NC_010831	TGG	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189499006
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144	NC_010831	TGT	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499006
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148	NC_010831	TATT	2	8	6860	6867	25 %	75 %	0 %	0 %	189499006
149	NC_010831	AAAC	2	8	6921	6928	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010831	A	7	7	6948	6954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010831	TTG	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010831	ATC	2	6	7040	7045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499007
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173	NC_010831	CTT	2	6	7876	7881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189499007
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249	NC_010831	AAG	2	6	11459	11464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_010831	ACTCT	2	10	11466	11475	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
251	NC_010831	A	6	6	11573	11578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_010831	AAC	2	6	11593	11598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_010831	AGTA	2	8	11611	11618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
254	NC_010831	TA	3	6	11650	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_010831	TATG	2	8	11666	11673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
256	NC_010831	T	6	6	11719	11724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_010831	ATG	2	6	11734	11739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_010831	CT	3	6	11741	11746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
259	NC_010831	ATGT	2	8	11752	11759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
260	NC_010831	AGG	2	6	11782	11787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010831	A	8	8	11878	11885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010831	GAA	2	6	11908	11913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010831	AT	3	6	11979	11984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010831	GA	3	6	12019	12024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
265	NC_010831	TCA	2	6	12075	12080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_010831	ATA	2	6	12093	12098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010831	A	7	7	12124	12130	100 %	0 %	0 %	0 %	189499009
268	NC_010831	CTGT	2	8	12142	12149	0 %	50 %	25 %	25 %	189499009
269	NC_010831	ATT	2	6	12154	12159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499009
270	NC_010831	CTG	2	6	12161	12166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499009
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272	NC_010831	CAG	2	6	12224	12229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499009
273	NC_010831	TAT	2	6	12315	12320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499009
274	NC_010831	ACG	2	6	12380	12385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499009
275	NC_010831	GAG	2	6	12433	12438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499009
276	NC_010831	CAA	2	6	12475	12480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189499009
277	NC_010831	AGC	2	6	12557	12562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499010
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279	NC_010831	GTT	3	9	12624	12632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189499010
280	NC_010831	GGA	2	6	12636	12641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499010
281	NC_010831	TGG	2	6	12644	12649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189499010
282	NC_010831	GCG	2	6	12657	12662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499010
283	NC_010831	AT	3	6	12665	12670	50 %	50 %	0 %	0 %	189499010
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285	NC_010831	GAC	2	6	12716	12721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499010
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288	NC_010831	TTGATT	2	12	12928	12939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189499010
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293	NC_010831	TCC	2	6	13073	13078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189499010
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295	NC_010831	TTA	2	6	13168	13173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499010
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303	NC_010831	GAA	2	6	13740	13745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189499010
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305	NC_010831	GTA	2	6	13984	13989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NC_010831	TA	3	6	14026	14031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_010831	GA	3	6	18359	18364	50 %	0 %	50 %	0 %	189499014
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399	NC_010831	ATC	2	6	18658	18663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499014
400	NC_010831	AG	3	6	18694	18699	50 %	0 %	50 %	0 %	189499014
401	NC_010831	GGA	2	6	18730	18735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189499014
402	NC_010831	CAG	2	6	18837	18842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499014
403	NC_010831	CGT	2	6	18843	18848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499014
404	NC_010831	GC	3	6	18869	18874	0 %	0 %	50 %	50 %	189499014
405	NC_010831	CAG	2	6	18900	18905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189499014
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413	NC_010831	CCGTA	2	10	19484	19493	20 %	20 %	20 %	40 %	189499015
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432	NC_010831	TAC	2	6	20581	20586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499015
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434	NC_010831	ATGT	2	8	20701	20708	25 %	50 %	25 %	0 %	189499015
435	NC_010831	TCA	2	6	20801	20806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189499015
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452	NC_010831	ATT	2	6	21723	21728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189499018
453	NC_010831	CTG	2	6	21880	21885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189499018
454	NC_010831	CGGA	2	8	22013	22020	25 %	0 %	50 %	25 %	189499018
455	NC_010831	CGG	2	6	22087	22092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189499018
456	NC_010831	TG	3	6	22148	22153	0 %	50 %	50 %	0 %	189499018
457	NC_010831	A	6	6	22240	22245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_010831	ATA	2	6	22279	22284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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